实验室废水的成分比较复杂，它受多种因素影响，如试验过程所用的原料、化学药剂、用水水质、水量、放射性同位素种类及使用后的化学组成等。一般废水可分为三类：含有机物质的废水、含无机物质的废水、含有机物质和无机物质的废水。
1.废水。一般有物理法、化学法、生物法等。物理法主要利用物理作用以分离废水中的悬浮物。化学法主要利用化学反应的作用来处理废水中的溶解物或胶体物质。生物法是利用微生物的作用去除废水中的交替和溶解的有机物质。
2.酸碱废水处理实验室排出一些酸性或碱性废水，由于实验室的性质和类型不同，所排出的酸性废水种类、浓度等都不相同。因此，酸性废水在需要处理时应和其他非酸性废水分流排出。酸性或碱性废水在可能和合理的情况下要尽量回收利用。
活毒废水处理设备宜设在最低处，便于污水收集和检修。
三级和四级生物安全实验室防护区活毒废水的处理装置应采用高温灭菌方式。应在适当位置预留采样口和采样操作空间。
四级生物安全实验室双扉高压灭菌器的排水应接人防护区废水排放系统。
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